La mosaïque africaine du manioc dans la région des grands lacs

Projet Mosaïque africaine du manioc
Epidémiologie, identification, résistance variétale et optimisation des rendements dans la région des Grands lacs

1. Description
Le manioc se classe au cinquième rang mondial des productions alimentaires. L’Afrique produit 50% du total de cette production. Toutefois, les rendements obtenus sont loin d’atteindre l’optimum et découragent les paysans pratiquant une agriculture de subsistance.
La mosaïque du manioc est une des contraintes majeures à la production du manioc rencontrées en Afrique. Plusieurs moyens de contrôle indirect de la maladie sont utilisés mais ils requièrent souvent une haute technicité difficilement adaptable en milieu paysan. Dès lors, l’utilisation de variétés tolérantes ou résistantes et l’introduction de pratiques culturales adaptées au contrôle de la maladie sont porteuses d’espoir pour l’avenir. Dans la région de Grands lacs, les recherches sur la connaissance et la maîtrise de la mosaïque africaine du manioc existent à peine dans quelques centres de recherche et universités.
Dans le souci de répondre à cette situation préoccupante et en tenant compte de l’importance de la culture du manioc dans la région que cette étude de l’épidémiologie et des souches du virus, et des variétés de manioc résistantes est proposée, dans l’optique de pouvoir proposer aux agriculteurs de la région des grands lacs une gestion adaptée de la maladie, qui intègre les spécificités locales et les particularités de la maladie en République Démocratique du Congo.

2. Objectif
Ce projet vise à étudier l’épidémiologie de cette maladie de la mosaïque du manioc, l’identifier des agents en interaction, évaluer la résistance variétale et l’optimiser les rendements dans les milieux paysans. Le but final est de proposer à l’agriculteur des variétés de manioc adaptées dans le milieu ainsi que les méthodes culturales adaptées à la lutte contre les vecteurs de la maladie.

3. Méthodologie
- Collecte des feuilles symptomatiques sur plants de manioc, sur les plantes hôtes naturelles du virus ainsi que des mouches blanches dans la région de Grands lacs (Burundi, DRC, Rwanda) en vue d’un typage.
- Vulgarisation, sensibilisation et journées porte ouverte auprès des agriculteurs et acteurs de développement
- Collection variétale de manioc in situ: variétés locales et améliorées
- Essais variétaux, essais d’inter- culture légumineuses alimentaires - manioc, essais multi- locaux en vue d’évaluer la pression parasitaire de la mouche blanche ainsi que l’intensité de la maladie en milieu réel ;
- Evaluation de résistance par la technique de greffage en milieu contrôlé et en milieu réel
- Caractérisation des cultivars de manioc locaux à l’aide d’un descripteur de manioc de Bioversity International ( ancien IPGRI) en vue d’une nomenclature uniformisée pour les chercheurs
- Relation plante -vecteur- virus par olfactométrie pour apprécier la préférence alimentaire de la mouche par rapport aux variétés de manioc et sa performance dans la transmission du virus.
- Etude de la diversité génétique des souches virales impliqués dans la MAM : sérologie par TAS-ELISA, moléculaire par PCR sur deux gènes majeurs impliqués dans la relation de résistance plante-virus : AC2 et AC4 ; séquençage et identification (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ , http://www.ebi.ac.uk/clustalw).
- Analyse des séquences disponibles de Begomovirus du manioc en vue de développer un outil moléculaire capable d’en détecter un grand nombre de souches possible.
- Quantification de virus par PCR quantitative en cas d’infection mixte en vue d’une corrélation avec les symptômes observés
- Caractérisation des souches virales par séquençage direct du génome total ADN A et ADN B ou par séquençage après clonage d’un plasmide (2800 bp)

4. Chercheurs impliqués
Prof. Claude Bragard ( UCL), Espoir Bisimwa (UCB), Damas Birindwa (UCB), Godefroid Monde (IFA), Gordien Niyongabo (Université du Burundi), Joseph Litucha (IFA), Ikolonga M. (PIDR), Pierre Bolonge (PIDR), Bruno Saquin (UCL), Yann (UCL), Prof. Jean Walangululu (UCB), J.Legg (IITA), Dr. Stephan Winter (DSMZ), Prof. J.B. Bahama (Université de Burundi), Pascal Ndayiragije (ISABU), Dr. Salvator Kaboneka (FAO Burundi), Pascal Nintije (ISABU), M.Twizeye (ISABU), Prof. Adrien Kalonji (Université de Kinshasa), Faustin Bolamba (FAO Kisangani), Joseph Ekofo (IITA Kisangani),

5. Collaboration
Université Catholique de Bukavu (UCB), Institut facultaire des Sciences agronomiques (IFA Yangambi), Institut des sciences agronomiques de Burundi (ISABU), Institut des sciences agronomiques du Rwanda (ISAR), Institut National d’Etudes et de Recherche Agronomiques (INERA) , International Institute of Tropical Agriculture (IITA), Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen GmbH (DSMZ), Programme Intégré pour le Développement Rural à Kisangani (PIDR), Fac. Agro Université de Burundi, Fac. Agro Université de Kinshasa, Food and Agriculture Organization (FAO)...

6. Publications et travaux rédigés
Monde, G. 2005 : Etude de virus de la mosaïque africaine du manioc par comparaison des gènes AC2 et AC4. Mémoire de DES, UCL- FUSAGx, Belgique
Niyongabo,G. 2007 : Etude de la diversité génétique des virus associés à la Mosaïque africaine du manioc au Burundi. Mémoire DEA, UCL, Belgique 39 p.
Saquin, B. 2007 : Suivi de la mosaïque africaine du manioc et de la résistance à celle -ci dans une parcelle d’essai à Bujumbura (Burundi). Mémoire de Bio - Ingénieur, UCL, Belgique, 115 p.
Monde, G & Bragard, C. 2007: Diversity of African cassava mosaic virus in Democratic Republic of Congo and in Burundi by comparison to genes AC2 and AC4. Poster, Ist ICCMD, 13-15 August 2007, Bukavu, DRC.
Monde, G. ; Walangululu, J. & Bragard,C.: Status of African cassava mosaic disease in Kisangani region in DRCongo. Oral communication, Ist ICCMD, 13-15 August 2007, Bukavu,
Birindwa, D., Bisimwa,E. & Bragard,C. ; 2007 : Essai de caractérisation des cultivars locaux de manioc au Sud Kivu. Oral communication, Ist ICCMD, 13-15 August 2007, Bukavu. Bisimwa, E., Birindwa,D. & Bragard,C.; 2007: Presence of begomoviruses on Cassava in Kivu. Ist ICCMD, 13-15 August 2007, Bukavu, DRC
Birindwa D., Bisimwa E., &Bragard C. 2007: Effect of inter-cropping on Cassava mosaic disease pressure. Ist ICCMD, 13-15 August 2007, Bukavu, DRC
Bisimwa,E., Birindwa,D.& Bragard C. 2007 : Yield losses under field and trial conditions. Ist ICCMD, 13-15 August 2007, Bukavu, DRC
Monde, G. ; Bolamba, F. ; Luana, R. & Bragard, C. : Evaluation du niveau de résistance de quelques variétés améliorées de manioc à la mosaïque africaine dans la région de Kisangani. Annales IFA Yangambi Vol. 1, 2007.
Saquin, B., Bragard, C. & Bahama, J.B : Follow-up of cassava mosaic disease in a trial field In Bujumbura . Ist ICCMD, 13-15 August 2007, Bukavu, DRC
Niyongabo,G., Nintije, P. Twizeye M. et Bragard C. : Etude de la diversité des virus associés à la mosaïque du manioc au Burundi . Ist ICCMD, 13-15 August 2007, Bukavu, DRC
Litucha J. 2007 : Rendement en feuilles en relation avec le niveau d’infection initial des boutures par la mosaïque africaine du manioc dans les conditions agro-écologiques de Kisangani. Ist ICCMD, 13-15 August 2007, Bukavu, DRC

Ir.Msc. MONDE Godefroid
Unité de Phytopathologie/Fac. Agronomie
Université Catholique de Louvain
B 1348 Louvain-La-Neuve/Belgique
mondekaz@yahoo.fr monde@fymy.ucl.ac.be
Tel +32 498195283 +243998648940 (RDC